Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms