Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms