Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms