Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Csde1Q91W50 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms