Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smg8Q8VE18 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smg8Q8VE18 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smg8Q8VE18 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smg8Q8VE18 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smg8Q8VE18 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smg8Q8VE18 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smg8Q8VE18 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smg8Q8VE18 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smg8Q8VE18 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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