Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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