Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ttc8Q8VD72 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ttc8Q8VD72 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttc8Q8VD72 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttc8Q8VD72 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttc8Q8VD72 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttc8Q8VD72 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms