Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms