Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms