Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms