Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrdQ8K2M3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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