Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms