Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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9030612E09RikQ8CE20 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
9030612E09RikQ8CE20 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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