Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms