Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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