Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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