Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc159Q8C963 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms