Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms