Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5S7

Rec8, Meiotic recombination protein REC8 homolog, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rec8Q8C5S7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rec8Q8C5S7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms