Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trim35Q8C006 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms