Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtpaQ8BWP5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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