Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms