Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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