Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pggt1bQ8BUY9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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