Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PgghgQ8BP56 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PgghgQ8BP56 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PgghgQ8BP56 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PgghgQ8BP56 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PgghgQ8BP56 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PgghgQ8BP56 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms