Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pum3Q8BKS9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pum3Q8BKS9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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