Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmco3Q8BH01 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms