Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms