Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms