Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg4bQ8BGE6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg4bQ8BGE6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg4bQ8BGE6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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