Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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