Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms