Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms