Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms