Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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