Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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