Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms