Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms