Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms