Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms