Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja6Q6S5G4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms