Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms