Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak2Q6P9N8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trak2Q6P9N8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms