Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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