Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac10Q6P3E7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms