Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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