Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mvb12bQ6KAU4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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