Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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