Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms