Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms